Сюжет
1x01 В Антарктиде найдены особые Звездные Врата, которые позволяют переместиться в далекую галактику Пегас, куда 10000 лет назад ушли Древние вместе со своим легендарным городом Атлантидой (Атлантисом). Однако экспедиция, отправившаяся туда, находит город пустым и погруженным под воду. МНТ истощены, энергии недостаточно ни на поддержание щита, ни на возвращение на Землю. Жители Атлантиса вынуждены искать новый дом в галактике Пегас.1x02 Деревня Атозианцев переживает нападение Рейфов. Многие жители забраны на корабли-ульи. Вместе с ними и полковник Самнер. Оставшихся жителей майор Шеппард перемещает на Атлантис, чем вызывает перегрузку щита и систем обеспечения. Но вместо затопления город поднимается на поверхность.1x03 Доктору Бекетту удается привить Родни МакКею ген Древних, и тот сразу надевает на себя персональное защитное поле. Во время игры в прятки мальчик-Атозианец заблудился в городе и случайно выпустил на свободу древнее энергетическое существо, питающееся электричеством. Высасывая энергию из генераторов, оно становится все больше и больше.1x04 К шее майора Шеппарда присосался инопланетный жук, питающийся жизнью, как и Рейфы. Экипаж джампера стремится быстрее вернуться на Атлантис, чтобы помочь ему, но корабль застревает во Вратах. У МакКея есть только 38 минут, чтобы починить джампер, прежде чем Врата закроются.1x05 Команда майора Шеппарда, отправляясь на исследование других планет, постоянно натыкается на засады Рейфов. Атлантийцы думают, что в городе появился шпион. Основное подозрение падает на Атозианцев. У Тейлы находят передатчик Рейфов, встроенный в амулет.1x06 Падл-джампер теряет управление и падает на планету, где люди живут только до 24 лет, а потом приносят себя в жертву. Они уверены, что именно это защищает их от нападения Рейфов. МакКей же считает, что причина в силовом поле, окружающем селения, которое поддерживает МНТ.1x07 Ученые планеты Хофф много лет пытаются изобрести вакцину, которая бы делала людей «несъедобными» для Рейфов. Бекетт помогает усовершенствовать его. Атлантийцы разрешают провести эксперимент с их пленным Рейфом. Однако вакцина имеет не просто защитный эффект.1x08 Тейла знакомит Атлантийцев с Дженаями - простым народом фермеров. Жители Атлантиса пытаются договориться с ними о поставках продовольствия. Но случайно МакКей и Шеппард обнаруживают подземный бункер и узнают, что Дженаи гораздо более развитая нация. Подземный город - их защита от Рейфов.1x09 Команда Шеппарда обнаруживает планету, покрытую заряженным туманом. Его энергии хватит, чтобы попасть на Землю через Врата. Шеппард, Вейр, МакКей, Тейла и Форд отправляются домой, но там они узнают, что у них нет возможности вернуться обратно на Атлантис, так как космический корабль Дедал поврежден. Да и вокруг творятся странные вещи.1x10 На город надвигается шторм. Атозианцы и Атлантийцы вынуждены эвакуироваться на другую планету. У МакКея и Зеленки есть план, как защитить город. МакКей, Вейр и Шеппард остаются на Атлантисе, чтобы реализовать его. Дженаи, воспользовавшись беззащитностью города, захватывают Атлантис.1x11 Шторм практически накрыл город. МакКей и Вейр в заложниках у командующего Коли. Шторм на материке на некоторое время стих. Бекетт, Тейла и Форд решают вернуться на Атлантис, чтобы помочь Шеппарду. Майор старается не допустить прибытия в город солдат Дженаев.1x12 Шеппард, МакКей и еще двое ученых, обследуя спутник Древних, улавливают слабый сигнал бедствия Рейфов с ближайшей планеты. Приземлившись, они обнаруживают пустой поврежденный корабль Рейфов. Но оказывается, что на борту есть один выживший Рейф, очень голодный и во что бы то ни стало желающий убраться с планеты.1x13 Во время осмотра повреждений, нанесенных штормом, двое ученых заражаются неким вирусом. Он вызывает галлюцинации, разрыв сосудов головного мозга, смерть наступает через несколько часов. Город объявляет карантин. МакКей уверен, что следующий он. Бекетт пытается решить проблему.1x14 Джампер Шеппарда спасается от погони. Внезапно Стрелы Рейфов поражает какая-то энергетическая волна, исходящая с планеты. Атлантийцы предполагают, что это особое оружие, но местные жители уверяют, что Рейфы не нападают на них, потому что их планету оберегает богиня Атор.1x15 В одном из отсеков Атлантиса Тейла, Шеппард и Форд находят стазисную кабину с очень старой женщиной внутри. Судя по показаниям, она провела там 10000 лет. Атлантийцы оживляют ее, считая, что она Древняя. Однако проснувшаяся женщина сообщает, что она - доктор Элизабет Вейр из параллельного пространства.1x16 Атлантийцы ищут МНТ на одной из планет, указанных в списке старой Вейр. По легенде здесь существовало братство, которое прятало некую вещь, называемую «потентией», которую они получили от Древнего. Дорога к ней зашифрована. Дженаи, узнав о появлении Атлантийцев, также хотят получить «потентию». 1x17 Через 2 недели корабли Рейфов долетят до Атлантиса. Атлантийцы хотят отправить письмо на Землю, среди полученных сведений они решают послать и личные сообщения от всех жителей Атлантиса. Шеппард и Тейла в это время застревают на одной из планет, атакуемых Рейфами.1x18 Тейле по ночам снятся кошмары, в которых она видит Рейфов на Атлантисе. Она пытается разобраться в своей способности предчувствовать приближение Рейфов. Бекетт, анализируя ее кровь, делает странное открытие: у Тейлы есть ген Рейфов.1x19 Атлантийцы эвакуируются из города, но в это время через Звездные Врата в Атлантис приходит подкрепление с Земли. Полковник Эверетт сообщает, что им надо продержаться несколько дней до прибытия Дедала. Он приказывает выставить вокруг планеты кольцо из бомб, на все башни города устанавливаются тяжелые батареи.1x20 Рейфы атакуют Атлантис. Бомбовый щит вокруг планеты сбит метеоритами, посланными Рейфами. Шеппард предлагает попросить атомные бомбы у Дженаев и послать их на корабль-улей на падл-джампере, управляя им дистанционно из кресла. МакКей и Зеленка пытаются осуществить это. Рейфы высаживаются на Атлантис.
